罗伯特·格雷道奇椅子安装仪式:Laszlo巴斯

东北人员连接基于分子相似的疾病

雷竞技app最新版raybet雷竞技东北大学网络科学家们发现一种连接疾病根据他们共享分子相互作用。发表在《科学,东北团队创建了一个数学工具来分析人类interactome-a地图在细胞和分子的相互作用的发现,交叠在一起的疾病抵抗疾病proteins-result modules-neighborhoods有时意想不到的疾病之间的关系。

这些发现在理解人类疾病构成一个了不起的一步。“越来越明显的是,人类疾病的上下文中只能解释细胞的组件之间的错综复杂的分子网络,”说巴拉巴斯罗伯特•格雷道奇教授网络科学和东北大学特聘教授和主任复杂网络研究中心。“直到现在才明显是可用的网络地图是否提供足够的覆盖率和准确性来帮助我们开始在这个路径。在本文中,我们表明,他们提供准确性和提供有价值的信息关于disease-disease分子起源的关系。”

研究小组分析了299种疾病,至少有226的疾病相关的基因,发现有自己的特定interactome中的“社区”。他们还发现,疾病远离彼此在interactome没什么共同点的分子功能或症状,而相同的“邻居”更相似。

共享基因只提供有限信息两种疾病之间的关系。通过应用他们的网络科学工具分析interactome,巴斯和他的团队发现,两个看似无关的疾病可以被连接基于网络疾病模块之间的距离。例如,他们发现哮喘、呼吸系统疾病、乳糜泻,小肠的一种自身免疫性疾病,局部重叠社区的建议共享分子根源尽管他们截然不同的病理学。

我们本文要做的是制定一个更数学为这个直观的想法,您可以使用interactome作为地图,”Jorg Menche说postodoctoral研究员和论文的作者之一。“它可能扮演了重要的角色在发展中更好的理解疾病在分子leveland补救措施。”

Menche提供网络地图的力量的一个例子,解释,医生通常诊断病人所描述的基于症状的患者。但他说,使用网络地图,可以找出发生在基因产物相互作用引起的特定疾病。

尽管令人印象深刻的进步interactome映射和疾病基因识别、interactome和疾病相关基因的知识仍然严重不完整。这种不完全性促使我们系统地研究当前数据在多大程度上能够绘制出疾病模块”Mensche补充说。

总之,”他说,“我们可以显示当前可用interactome数据已经达到足够覆盖系统地调查许多疾病的分子机制,以及在分子水平上探索pathobiological疾病之间的关系。”

东北的研究人员是建立在复杂网络研究中心。团队由巴斯Menche,博士后研究员Maskim Kitsak, Amitabh沙玛,研究助理教授和研究生物理学生苏珊•迪娜Ghiassian博士”15。

最初发表在(电子邮件保护)2015年2月23日。

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