由安吉拉鲱鱼
人类基因组是一个庞大的零件清单内工作的生物学。它编码成千上万的蛋白质使我们我们是谁,保持我们的身体启动并运行。虽然零件清单是十年前,其效用仍然有限,我们仍然没有接线图。也就是说,我们不知道所有的部分是如何交互的。
“这就是真正的丰富的现象产生,”巴鲁克巴赛尔说,博士后复杂网络研究中心,该实验室由世界知名网络科学家和杰出的大学教授巴拉巴斯。“疾病机制,以及我们健康的功能,都是编码不仅在基因和蛋白质,而且在他们如何相互作用形成一个网络。”
但与许多网站里面的组件在你的汽车引擎或电线机械doll-biological系统黑盒。我们可以观察到他们的交互作用的结果,而不是本身的交互。
在工作发表周日在线杂志自然生物技术巴赛尔内里建立了一个数学方法,盒子。研究移动团队一步在寻求理解,预测和控制人类疾病。
据估计,只有0.01%的所有可能的相互作用在人类基因组中发生,巴赛尔说。但是有20000个基因,仍高达100000互动的空间。因为盲目搜索这些将不可行,科学家研制出了高通量实验方法有效检测。唯一的问题是,再一次,这黑盒。
细胞的实验数据提供了全球图片毕竟发生了相互作用。例如,如果蛋白质影响蛋白B,进而影响蛋白质C,蛋白A和C之间的联系也会注册。巴赛尔的方法允许他“沉默”那些间接的联系。
“沉默之后,剩下的是精确系统的接线图,”巴赛尔说。“在某种意义上我们一窥黑盒”。
测试方法,4511年巴赛尔网络应用到大肠杆菌的基因。他发现这个方法执行67%比标准的相关方法更好的识别真正的互动。
但是他们的接线图仅仅是个开始。“你不只是想知道哪个组件其他组件的行为,但也会影响人们的行为。相互作用的机理是意识到,“巴赛尔说。“这是一个完全新鲜的问题,和我们的方法可以帮助解决它。”
继续研究东北主要在网络科学工作,作为其研究人员解决一系列的项目在这个新兴领域,包括理解支配所有系统的复杂性。这个工作从研究疾病的全球传播分析来更好地理解社交媒体数据字段从政治科学防灾准备。
东北也宣布全国第一个博士项目的启动网络科学。大学将在秋季招聘开始。
