李马克维斯奇博士
教授和椅子
206年跨学科科学和工程复杂
617.373.7805
生物工程部门为学生提供了一个广泛的教育建立在基础科学、数学、工程,重点是生物工程的应用。该计划旨在提供一个严格的工程训练和全面了解生物内在约束设计人工系统接口,增加、更换、修理、或监测生命系统。这些约束取决于相关生物系统的属性和功能。人体生命系统可能;一个生态系统;或者更广泛地说,生物反应器,组织培养系统,与生活组件或任何系统。天然生物组织的存在的地方特别限制人工构造及其接口的设计和实现生命系统。工程师们是工程师全面了解工程要求固有在生物环境中工作。
生物工程是一个相对较新的领域的生物系统的认识到工程或系统接口与生命系统需要一个多学科的方法,考虑了机械、电气、化工、和材料属性的生物系统。有鉴于此,生物工程项目设计提供一个严格的工程教育,赋予广泛的理解生物系统的定量分析和深度在四个领域之一,生物工程专业。六的课程是围绕一个核心课程从多个角度定量分析生物系统。核心提供了定量生理学的基本原理,电气工程中可兴奋组织;机械工程的基本知识在肌肉骨骼系统的上下文;和热力学、传热和流体力学的生理系统。完成核心,学生选择四个浓度(生物医学设备和bioimaging;细胞和组织工程;生物力学;或系统、合成和计算生物工程),它提供了机会开发一个深度的专业知识在生物工程的一个重要领域。 The curriculum culminates with a two-semester capstone course to provide experience in design and implementation of a novel bioengineering project.
部门的任务
该计划致力于提供一个多学科教育,使连接从教室和实验室研究,合作社,辅助课程的经验。课程提供基础数学、物理科学和工程科学;实验室经验;以及强调特殊考虑内在设计在生物环境中。通过大学的教育需求,学生获得的认识工程决策的影响在一个更广泛的社会和道德环境。通过积极参与部门鼓励专业发展和领导在学生组织中,社会,和部门活动。因此,生物工程项目旨在培养学生成功的工业事业;研究生课程;或专业医疗、法律和商学院。
其他编程功能
通过参与我们的合作教育项目,我们的毕业生将有机会探索职业目标适合自己的技能和兴趣。这个组件的项目的目标是为学生提供有价值的专业经验和联系,这将有助于让他们开始他们的职业生涯,以及职业生涯发展管理技能。合作社项目相似的学术项目的责任和成熟水平。
部门还提供了所有生物工程领域重要的研究机会,包括参与研究中心位于我们部门和大学,以及新的跨学科研究生和专业硕士项目。
生物工程课程是一个创新的计划,不断仔细的评估和评估,以确保项目的毕业生的成功专业工程师都有充分的思想准备,准备或职业学校毕业。
生物工程课程
BIOE 1990。选择性。(1 - 4小时)
提供选修学分课程在其他学术机构。可能是无限重复。
BIOE 2350。生物力学。(4小时)
旨在使学生熟悉概念,应力,应变,和本构规律应用于生物力学问题。介绍了刚体和变形体力学。着重于固体力学的基本基础使用矢量和张量。说明性的例子从组织和细胞生物力学在适当的地方给出。
先决条件:(数学1252最低等级的D -或数学1342最低级的D -);(1151年的今天最低等级的D -或1161年的今天最低等级的D -或1171年的今天最低级的D -)
BIOE 2355。定量生理学工程师们。(4小时)
介绍了工程和科学学生生理系统和流程的核心知识和理解。关注人类的生理系统的定量分析。主题包括生理的物理和化学基础;耦合的部队和流动;电气、机械和化学势及其共轭通量;的生理兴奋性组织。研究细胞结构、功能和体内平衡,重点关注膜运输、渗透压、细胞信号传导和细胞能量。
先决条件:(数学2341(可能同时服用),最低等级的D -或通用电气2361(可能并发),最低等级的D -);(化学1151最低等级的D -或化学1161最低等级的D -或化学1211最低级的D -或化学1217,最低等级的D -);(1155年的今天(可能同时服用),最低等级的D -或1165年的今天(可能同时服用),最低等级的D -或1175年的今天(可能并发),最低等级的D -)
BIOE 2365。生物工程测量、实验和统计数据。(4小时)
介绍了生物医学数据采集和统计分析的基础。工程统计主题包括描述性统计、概率分布、假设检验、方差分析和实验设计。适用于这些统计主题通过分析数据从实验室获得练习BIOE 2366。实验室练习主题包括细胞培养、机械测试、建模医学成像数据,3 d打印技术,生物打印。强调使用MATLAB软件分析数据在电脑上。
先决条件:(杂志1107年(可能同时服用),最低等级的D -或杂志1111年(可能同时服用),最低等级的D -或杂志1115年(可能并发),最低等级的D -);(数学1252(可能同时服用),最低等级的D -或数学1342(可能并发),最低等级的D -);(ENGW 1111最低等级的C或ENGW 1102最低级的C)
并修课程(s):BIOE 2366
属性(s):NUpath /使用数据分析,NUpath写密集型
BIOE 2949。在生物工程入门指导研究。(4小时)
提供了一个机会去追求项目和其他独立调查机会为第一、二学年学生在教师的监督下。课程与student-developed发起提案,包括预期的学习成果和研究产品,教员在主管部门核准。许可所需的教练。
BIOE 2990。选择性。(1 - 4小时)
提供选修学分课程在其他学术机构。可能是无限重复。
BIOE 3210。生物电。(4小时)
讨论了电路原理,信号和系统的工作原理的系统在多个生理尺度。提供学生一个机会来获得所需的基本背景界面生物系统与电路和传感器测量。涵盖了电活性组织的结构和功能原理包括神经、大脑和肌肉,包括心脏。
先决条件:(通用电气2361最低级的D -或(数学2321最低级的D -;数学2341最低级的D -));(1155年的今天最低等级的D -或1165年的今天最低等级的D -或1175年的今天最低级的D -)
BIOE 3310。运输和工程师们的液体。(4小时)
涵盖了基本原则的过程和系统质量,能量,动量是运输在典型生物问题。强调为不可压缩和可压缩流体动力传输(流体)和能源运输。的方法教相关生理系统的分析,处理和生物材料的分离。
先决条件:BIOE 2350最低级的D -;BIOE 2355最低级的D -;(通用电气2361最低级的D -或(数学2321最低级的D -;数学2341最低级的D -))
BIOE 3380。生物分子动力学和控制。(4小时)
关注的热力学和动力学原理应用于生物分子系统的分析和设计。涵盖了基本的质量和能量平衡”等话题,化学平衡,酶动力学生物背景。介绍了反馈和前馈控制生物分子网络的作用,强调基本分析和计算方法,包括使用MATLAB,分析这些监管结构如何影响小规模的动力学,典型的网络。
先决条件:(通用电气2361最低级的D -或(数学2321最低级的D -;数学2341最低级的D -));BIOE 2355最低等级的D -
BIOE 3410。实验室方法。(4小时)
提供先进的生物工程实验室练习,强调技术的核心分子,细胞和组织工程。实验室锻炼主题包括PCR和qPCR、蛋白质化学、bioconjugation,酶动力学和es交互,聚合物,表面改性,3 d生物打印,荧光显微镜和图像分析。建立在之前的课程的学生通过应用实验设计概念,包括样本量选择统计力量,重复和复制,实验治疗和分组方差分析和混合模型分析,并设计一个健壮的标准曲线,研究问题。学生运用MATLAB,显微镜成像软件,可视化和分子对接软件分析实验数据。要求课堂参与和实验室作业和报告所有的学生写的。
先决条件:BIOE 2365最低级的D -;BIOE 2366最低等级的D -
BIOE 3990。选择性。(1 - 4小时)
提供选修学分课程在其他学术机构。可能是无限重复。
BIOE 4790。顶石设计1。(4小时)
提供了第一个在一个双向的顶点序列设计。介绍了工程设计原则和应用生物工程设备的设计。主题包括道德、成本工程,研究方法、知识产权、技术报告写作,和FDA设计控制输入,输出,验证,验证和设计历史文件。学生们形成团队和搭配了一个教师顾问和支持者。项目支持部门,工业,也可以是外部的。学生保护初步设计项目建议书在教员陪审团前书面和口头形式。
属性(s):NUpath顶石的经验,NUpath创造性表达/创新,NUpath写密集型
BIOE 4792。顶石设计2。(4小时)
仍在继续BIOE 4790。提供学生一个机会来设计原则适用于创建一个设备或流程来解决相关的生物工程问题。团队开发、构建和评估原型在真实世界的财政、监管和安全条件。进步是监控通过一系列设计门的口头报告审查会议。设计过程记录在整个课程设计历史文件审查。要求学生完成一个工作原型或模拟,适当的和最终的书面报告。
先决条件:BIOE 4790最低等级的D -
属性(s):NUpath顶石的经验,NUpath创造性表达/创新,NUpath写密集型
BIOE 4970。初级/高级荣誉项目1。(4小时)
重点是深入项目的学生进行研究或生产产品相关学生的主要领域。结合初级/高级项目2或college-defined 8-credit荣誉项目。可能是无限重复。
BIOE 4990。选择性。(1 - 4小时)
提供选修学分课程在其他学术机构。可能是无限重复。
BIOE 4991。研究。(4小时)
在老师的监督下进行研究提供了一个机会。可能是无限重复。
属性(s):NUpath集成经验
BIOE 4992。直接研究。(1 - 4小时)
提供了理论或实验工作的部门成员的指导下选择的主题。课程内容取决于教练。可能是无限重复。
BIOE 5060。在生物工程专题。(4小时)
关注的话题感兴趣及时科学与工程的学生。主题不同学期的学期。在适当的时候,课程利用独特的机会通过访问教师和客人。可以重复一次。
BIOE 5115。在生物工程动力系统。(4小时)
介绍了动力系统的理论分析和建模在生物学,从分子到人口的应用程序。主题包括差异和微分方程模型,基本理论包括nondimensionalization、稳定的状态,线性化,稳定,特征值,全球行为,奇异扰动,多稳定性、磁滞,协同,周期解,兴奋性系统,分岔;和介绍空间(PDE)模型。发展概念在具体的上下文中生物应用,如基因调控;化学反应网络和化学计量学;药物和PK / PD模型;受体/配位体的相互作用;合成结构;动作电位的一代;酶促反应; population interactions; epidemiology; epigenetic phenomena, including differentiation and transport; chemotaxis; and diffusion.
先决条件:数学2341最低等级的D -或通用电气2361最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5235。生物医学成像。(4小时)
介绍了现代医学成像的基础,包括成像原理、成像数学、物理成像和图像生成技术。包括x射线、超声、ct和磁共振成像。
先决条件:BIOE 3210最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5250。医疗设备的设计、制造、和评价。(4小时)
覆盖工程设计挑战固有的生物医学设备的发展,包括临床评估、制造、医疗设备和测试和FDA法规对这些流程的约束。主题包括质量体系、设计控制、网络安全的担忧,全球设备监管标准的作用,设计过程中。学生被要求形成团队和执行一个学期的概念设计项目开发设计概述,设计方案,设计输入规格,和一种新型医疗设备的验证测试程序。
BIOE 5410。分子生物工程。(4小时)
介绍了基础的分子生物大分子的结构和功能,支撑工程。建立在这个基础与应用程序设计概念的分子结构和功能分析的方法和策略来治疗分子的设计和重新设计。项目试图在概念设计为学生提供经验创建策略来解决重大的健康问题。
先决条件:((杂志1111年最低等级的D -或杂志1115年最低级的D -);BIOE 2355最低级的D -;数学1342最低级的D -)或研究生项目录取
BIOE 5420。细胞工程。(4小时)
分析技术,形成分子细胞工程的基础,包括DNA重组,克隆和基因组学、原核和真核基因调控和单细胞基因表达,结构,基因调控网络的动力学,新陈代谢和细胞能量,细胞结构中,细胞骨架和细胞马达,合成基因电路,和代谢工程。
先决条件:BIOE 2355最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5430。组织工程学的原理及应用。(4小时)
生物学和生物医学工程的原则适用于人造器官用于移植的创建,基础研究、药物开发。需要整合知识的有机化学、细胞生物学、遗传学、力学、生物材料、纳米技术和运输过程创建功能器官。评论基本的细胞培养技术、结构功能关系、细胞通讯、自然和人工生物材料,调节细胞生存和组织机构的基本方程。
先决条件:BIOE 2355最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5440。细胞作为一个机器。(4小时)
介绍了物理力量的关键角色,细胞外基质和细胞骨架结构在人类疾病的发展。细胞被视为一个工程系统能够感知物理线索从它的环境,从不同mechano-sensors整合这些信息,应对外部环境的变化在一个一致的方式。使用数学和计算模型来解释细胞如何感知和响应的物理信号。
先决条件:(BIOE 2350最低级的D -;BIOE 3380最低级的D -)或研究生项目录取
BIOE 5450。干细胞工程。(4小时)
涵盖工程原则和方法在干细胞研究及其在组织工程和再生医学中的应用。最近强调技术和工程工具用于理解和操作干细胞。主题包括胚胎和成年干细胞生物学基础;干细胞信号的定量建模;基因/生物化学/生物物理、生物力学、生物材料工具来控制干细胞的命运和分化;编辑和细胞表观遗传重编程;工程仿生和生物反应器环境开发干细胞为基础的治疗;在组织发展和各种应用,疾病,和再生。
先决条件:(BIOE 5420最低等级的C -或BIOE 5420最低级的D -);(BIOE 5430最低等级的C -或BIOE 5430最低级的D -)
BIOE 5510。生物工程/技术商业化的产品。(4小时)
着重于翻译和生物工程产品和技术的商业化。提供学生一个机会来获得关键的创业技能,通过学习和锻炼的关键要素和流程建立和启动一个生物技术创业公司。研究如何评估生物工程产品和技术的机会,评估技术的市场潜力,在知识产权保护和食品及药物管理局监管的景观生物工程产品,形成一个生物技术创业公司,写一个商业计划,并向潜在投资者的创业公司。涵盖了工程经济学原理。
BIOE 5630。生理上的流体力学。(4小时)
biofluids及其力学分析,包括心血管流体力学。例子是来自生物技术过程和生理应用程序,包括心血管、呼吸道、眼、肾、肌肉骨骼和胃肠道系统。主题包括量纲分析,粒子运动学在欧拉和拉格朗日坐标系,本构方程和牛顿/非牛顿biofluid模型,在灵活的管流和波传播,振动和脉动的流。
先决条件:BIOE 3310最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5640。计算生物力学。(4小时)
识别和评价基本守恒原则,治理结构力学和流体力学在生物系统。讨论下列数值分析技术:参数估计、有限差分数值积分,有限元方法。通过结合守恒定律与数值分析技术,开发方法来描述各种生物系统的生理功能,允许一个方程组是用来描述一个生物问题解决这个系统数值预测其行为。
BIOE 5648。生物医学光学。(4小时)
包括生物医学光学和论述了生物学和医学的理论和实践应用的激光。主题包括生物组织中光传播原理;件轻松事交互,如弹性和非弹性散射;荧光和磷光;诊断成像技术,如共焦荧光显微镜、扩散光学断层扫描和光学相干断层扫描;和介入治疗技术,包括光动力治疗,激光热疗法,和fluorescence-guided手术。EECE 5648和BIOE 5648跨境上市。
先决条件:BIOE 3210最低等级的D -或EECE 2150最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5650。多尺度生物力学。(4小时)
旨在帮助学生开发和扩展法和连续介质力学应用于生物力学现象在不同长度尺度从单个分子,上升到细胞和组织水平。主题包括组织结构和宏观性质的分子基础;化学和电气对力学性能的影响;细胞力学、运动性和附着力;生物膜;生物分子力学和分子马达;和实验方法探索结构的组织,细胞和分子水平。
先决条件:(BIOE 2355最低级的D -;(数学2341最低等级的D -或通用电气2361最低级的D -))或研究生项目录取
BIOE 5656。在生物系统中字段、力量和流。(4小时)
介绍了电流的基本驱动力,流体流动,和大众运输,加上各种生物系统的应用程序。研究基本的数学和工程工具的生物学和生理学。认为各种动电的现象为例,chemical-electro-mechanical驱动力的耦合特性。应用包括运输在生物组织和跨膜、细胞和生物分子的操纵,微流体。
先决条件:((数学2341最低等级的D -或通用电气2361最低级的D -);BIOE 2355最低级的D -)或研究生项目录取
BIOE 5710。实验系统和合成生物工程。(4小时)
介绍了实验系统和合成生物工程的各个方面。提供学生一个机会来学习如何计划和执行定量实验,如何应用工程原则设计实验室研究和解释数据,以及如何设计和实现合成基因或酶的电路。通过团队项目,探讨了技术在核酸,蛋白质,和基因工程;在单个细胞水平定量测量和超越;合成电路的设计和应用;并讨论了伦理方面的考虑。
先决条件:BIOE 2355最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5720。物理生物工程。(4小时)
涵盖了生物聚合物的构象、细胞膜力学、化学反应动力学和应用聚合和分子马达,电场和动作电位传播。近年来一个巨大的增长在思想和方法的使用从物理科学与工程获得更好的理解生物现象和应用,了解社会需求,从健康到农业。潜在的这些努力从统计物理学原理建立的框架越来越受欢迎的生物工程的一部分。
先决条件:BIOE 2365最低等级的D -或BIOE 3380最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5750。在生物工程建模和推理。(4小时)
开发一组统计工具来解决逆问题造成不良。解释复杂,部分信息是一个日常任务的研究,以及在我们的日常生活中。这些任务包括评估量化属性间接噪声测量的生物系统,应对环境波动信号,或破坏加密消息。常见的这些不同的问题需要从部分数据建立预测模型。利用例子从生物学的主要文学研究文字识别,特征映射,序列比对,解码密码,处理chemoattractive信号找到食物和不可预测的环境中细菌的生存策略。
先决条件:((数学2321最低级的D -;数学2341最低级的D -);(BIOE 2365最低级的D -或(CHME 3315最低级的D -;CHME 4315最低级的D -)))或研究生项目录取
BIOE 5760。在系统生物学和生物工程方法和逻辑。(4小时)
强调困难的界面理论和实验在生物工程和系统生物学。包括干细胞工程、定向分化、工程生物电路,协同,健壮的适应,动能校对,信号转导和信息处理在生物系统中,网络分析,动力系统和生物设计原则。本课程是基于阅读和讨论主要文献例证的方法,揭示了新生物系统的概念和原则。每周,学生阅读和讨论两个重要文件。老师提供相关背景和框架的研究论文中,他们的时间作为课堂讨论的基础。
先决条件:BIOE 2355最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5800。系统、信号和控制工程师们。(4小时)
探索系统的概念和转移函数允许工程师将一个复杂的系统分解成更简单的系统和简单的模块结合,形成复杂的功能。提出了一套分析工具和侧重于应用频域分析(如傅里叶变换,拉普拉斯,Z变换)简化连续和离散时间系统和获得的见解关于其稳定性和频率响应。提供学生一个机会来理解,描述,结合电子和生物产生的模拟和数字信号电路,以及设计控制器的方法来实现所需的生物系统的行为。使用这些知识,学生设计过滤器和控制器,在模拟和数字形式,并测量和操作复杂的真实世界的生物工程系统(包括2 d图像处理信号)。
先决条件:BIOE 3210最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5810。生物医学仪器的设计。(4小时)
研究生物学和工程学的原则基础生物医学仪器的设计和使用。主题包括范围广泛的仪器设计和监控设备,传感器和集成系统。感兴趣的研究生应该选修这门课程已经完成了一个等效电路导论。
先决条件:(BIOE 2350最低级的D -;BIOE 2365最低级的D -;BIOE 3210最低级的D -)或研究生项目录取
BIOE 5820。生物材料。(4小时)
提供了一个广泛的概述生物材料领域(材料用于医疗设备,与生活组织)。介绍性讲座涵盖生物材料及其翻译从实验室到医疗市场。讨论了重要的生物材料术语和概念。强调材料structure-property-function-testing关系和讨论具体的材料用于医疗设备和药物输送。总结介绍主题,如biomaterials-tissue交互,组织工程和监管要求。考虑设备设计原理与生物材料的选择和应用。
先决条件:(化学1151最低等级的D -或化学1161最低等级的D -或化学1211最低级的D -或化学1217,最低等级的D -)或研究生项目录取
BIOE 5850。植入物的设计。(4小时)
使用一个跨学科的方法来评估一个团队设计的人体植入物以满足未满足临床需求。/表面科学,涵盖生物材料、界面现象现象/表面科学、淋巴系统,免疫反应,老化,机械因素、灭菌方法和人为因素。礼物外生因素,包括知识产权、监管要求,支付能力,产品责任和生物伦理学。类分为团队设计专有医疗设备使用单位提出的流程/案例研究方法有第一手经验的专家,满足市场需求。
先决条件:BIOE 5820(可能同时服用),最低等级的D -或BIOE 5820(可能并发),最低等级的C -(研究生)
BIOE 5860。工程方法精密医学i(4小时)
包括生物医学领域的科学数据。从生物医学团队的学生承担项目征集π在生物医学研究领域,使用数据集和开发项目工作计划。研究如何评估病人的健康使用他们的健康状态数据和使用建模和机器学习方法做出个性化的预测项目的健康状态。包括专题生理学、医学和工程原则(概率,机器学习)相关的每一个项目;指导老师帮助学生项目的挑战。需要项目定期更新类,这样团队获得经验与展示。
先决条件:数学2341最低等级的D -或数学2331最低级的D -或研究生项目录取
BIOE 5870。工程方法精密医学二世。(4小时)
适用于生物医学数据科学方法开发的核心知识BIOE 5860学生的研究项目的指导下生物医学和工程π。研究项目来源于临床研究,旨在培养学生在理解数学和计算定义和估计病人的健康状况以及如何使用建模和机器学习的方法来进行个性化的预测。成功地使提前预测允许医生进行早期干预,帮助病人。
先决条件:BIOE 5860最低等级的C -
BIOE 5880。在系统生物工程计算方法。(4小时)
向学生介绍在系统生物学的研究中使用的计算方法,计算生物工程和数据科学及其扩展工具广泛的应用于科学和工程。介绍了数值方法的基本元素和算法解决不同类型的微分方程,模拟运行,并进行优化和数据分析。强调每个算法的概念和原理及其在R编程的上下文中使用真实世界的应用程序在系统生物学、生物信息学、计算生物学和数据科学。
先决条件:BIOE 3380最低级的D -或研究生项目录取