研究总结
威廉姆斯实验室专业发展的单分子定量调查方法核酸相互作用为了理解这些交互作用的过程,如复制和转录。这些研究的核心是寻找蛋白质与核酸相互作用的机制来改变他们的生物物理特性,从而实现其特定的生物活性。这些研究都是在每个生物系统与专家合作,和蛋白质的活动监控各种体外和体内的研究来确定观察到的生物物理机制是体现在一个完整的生物系统的水平。
单分子生物相互作用的研究
分子机制的逆转录病毒和逆转录转座子replicat离子相互作用
这项工作探讨了蛋白质与核酸的相互作用,参与hiv - 1复制,包括人类先天免疫系统APOBEC3蛋白质,主要关注APOBEC3G和APOBEC3H,既抑制hiv - 1复制病毒蛋白Vif的没有。我们也调查的交互LINE1 ORF1p,蛋白质必不可少的逆转录转座子复制。
核小体可访问性和真核生物的转录调控蛋白
我们开发了单分子DNA拉伸方法来研究DNA蛋白质交互HMGB等真核调控蛋白的蛋白质,包括单个核小体阵列的研究。我们发现核小体由HMGB蛋白质不稳定,和正在进行的研究调查大得多的蛋白质,也促进了核小体重新组装。
机制从模型复制系统的DNA结合蛋白质
通过监测DNA结合使用光学镊子,结合动态绑定模板切换的能力从双链DNA单链DNA,我们已经确定的机制几个蛋白质促进复制生物系统。我们调查的动态复制从噬菌体的交互以及那些参与大肠杆菌复制。
热力学和结构动力学的小分子结合的DNA
我们的方法揭示了DNA的结构动力学和热力学的小分子结合,揭示了能源格局的交互。这些研究包括开创性工作了解抗癌药物放线菌素D,一系列的活动ruthenium-based化合物有复杂的DNA线程绑定机制,和cisplatin-based intercalator phenanthriplatin。
hiv - 1复制交互
最近的研究表明hiv - 1核衣壳蛋白浓缩DNA,提供一种机制来调节衣壳脱壳的时机。
核小体在真核系统可访问性
这项研究表明人类的核小体伴护蛋白质事实帮助拆卸和重新组装核小体促进转录。
小分子结合的DNA
我们描述小分子dna的能源格局优化特征为潜在的抗癌药物的相互作用。本研究显示夹层紧随其后的是有前途的抗癌药物phenanthriplatin共价结合。