在实验室的冈瑟K.H. Zupanc布朗鬼鱼(Apteronotus leptorhynchus)有一个重要的角色在推进Zupanc的研究人类神经系统。小鱼,常见的亚马逊流域,电动惊喜在它们的身体里伸出来。物种的一部分电器官可以产生电场,knifefish的微弱的放电特性类似于人类大脑神经振荡器。这些振子在人类控制我们的有节奏的行为,如呼吸和心跳。

神经网络建模发现集群

通过构建一个振荡器的计算模型称为起搏器核,Zupanc能找到强有力的理论证据的某些离子参与调节神经振荡的频率起搏器核。

然而,这些类型的运行非常复杂的模型需要大量的计算能力,可能需要几个星期甚至几个月最先进的桌面系统上运行。为了减少计算时间,Zupanc的团队转向东北的研究团队计算(RC)援助来访问发现集群东北大学的高性能计算资源,研究社区。raybet雷竞技雷竞技app最新版

RC的计算机科学家

马里亚纳利未,博士于2019年加入东北的研究团队计算。加入了球队,在此之前,她是一个博士生在美国华福研究小组,集中在理论和计算分子生物物理学。目前,马里亚纳的研究计算团队的计算机科学家,帮助研究人员与各种援助帮助安装科学软件程序,提高代码的效率和速度,主要训练创造弹性工作流。

她第一次接洽丹尼尔•哈特曼本科研究员冈瑟的实验室,访问和使用发现集群。“他们可能不能做在他们的个人笔记本电脑,“利瓦伊说。“这是不可能的。这肯定是和发现成为可能。”

合作加速科学

利未与Zupanc紧密合作的团队,能够提供专业援助,帮助构建和优化计算模型。“马里亚纳有很强的生物物理学的研究背景,“Zupanc州,“她不仅可以帮助调整计算机代码运行的模拟发现,但也能理解研究项目,并提供她研究的输入。“李维斯输入是至关重要的成功研究,已经给了她共同创作产生的纸,建模的持续自发网络振荡性二态的脑干核:钾平衡电势的作用,2021年发表在计算神经科学杂志》上。

”最积极的一个方面的工作是伟大的团队精神在团队的所有成员,包括马里亚纳作为我们的研究计算合作者。一个复杂和富有挑战性的项目如我们所做的可能只有在所有团队成员密切合作,很好。马里亚纳这样的团队精神的化身!“冈瑟Zupanc

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参考

哈特曼,丹尼尔,Lehotzky,大卫,Ilies Iulian,李维,马里亚纳,& Zupanc·k·h·(2021)。建模的持续自发网络振荡性二态的脑干核:钾平衡电势的作用。计算神经科学杂志》上。https://doi.org/10.1007/s10827 - 021 - 00789 - 2