我的研究小组研究海洋生物的进化和生态利用尖端,下一代测序,彻底改变了分子遗传学提供前所未有的访问在任何生物体的基因组或转录组基因变异。因此,现在可以进行深入的基因研究任何生物而不是几易处理的“模型”的生物。
我们利用基因组学问海洋生物如何应对和适应他们的环境。例如,我们使用RNA序列(RNAseq)概要文件如何海洋生物,像热带礁珊瑚,应对环境压力,如病原体接触和热应力。我们使用全基因组测序和RADseq问进化如何影响海洋生物随着时间的推移,反过来,将影响他们的适应能力和适应未来气候情景。我们利用宏基因组研究珊瑚和微生物之间的复杂交互识别假定的细菌共生生物和病原体,并概要文件的变化coral-microbe社区变化扰动等疾病感染或温度应力。
正在进行的项目(更多信息,请参见项目页面)
珊瑚的免疫力和抵抗疾病|同意研究RNA-sequencing用来描述濒危鹿角珊瑚感染的免疫反应白色带疾病和识别在鹿角珊瑚抗病性的遗传基础。
珊瑚微生物:共生生物和病原体|同意与Gouhier实验室合作研究集中在识别珊瑚微生物共生生物和病原体之间的竞争如何影响珊瑚微生物。我们的研究结合了珊瑚微生物meta-genomics和meta-transcriptomics传染病模型研究鹿角珊瑚微生物的动态。
珊瑚物种形成和杂交|珊瑚礁是由造礁珊瑚(或Scleractinian)的不同组合。然而,如何保持这种珊瑚多样性的起源和仍知之甚少。一个关键的问题围绕着多高珊瑚物种多样性维持的高杂化潜力。我们的工作在加勒比海疣和东太平洋Pocillopora杂交系统特征之间的渐渗杂交模式和利率珊瑚物种和证明遗传混合通常是有限的选择对混合基因。